Клинические базы университета
Учебно-научный центр охраны здоровья матери и ребенка Государственный медицинский университет Туркменистана имени Мырата Гаррыева: Kaфедра акушерства и гинекологии, кафедра детской хирургии, кафедра пропедевтики детских болезней, кафедра госпитальной педиатрии, кафедра педиатрии последипломного образования.
Стоматологический учебно-производственный центр Государственный медицинский университет Туркменистана имени Мырата Гаррыева: Кафедра терапевтической стоматологии, кафедра ортопедической и хирургической стоматологии, кафедра детской стоматологии, кафедра последипломной подготовки по стоматологии.
Научно-клинический центр Глазных болезней Государственный медицинский университет Туркменистана имени Мырата Гаррыева: Кафедра глазных болезней.
Дирекция центров инфекционных болезней: Кафедра инфекционных болезней, кафедра эпидемиологии, кафедра туберкулеза, кафедра кожных и венерических болезней, кафедра детских инфекционных болезней.
Научно-клинический центр онкологии: Кафедра лучевой диагностики, лучевой терапии и онкологии.
Центр общественного здоровья и питания: Кафедра гигиены питания.